DNA modification
Pre-validated reporter-quencher pairs for TaqMan qPCR probes, molecular beacons, and multiplexed detection — optimized for signal-to-noise and compatibility with standard instruments.
| DNA modification | |
| 5′ Modification | Internal Modification |
| Source data — DNA modification list | ||||
| 5′ Modification | ||||
| 5'Acrydite（Like） | 5'Alexa Fluor 700（Like） | 5'C12-NH2 | 5'DIG（Like） | 5'Quasar 670（Like） |
| 5'Alexa Flour 350（Like） | 5'Alexa Fluor 750（Like） | 5'C6-NH2 | 5'ET-ROX（Like） | 5'Quasar 705（Like） |
| 5'Alexa Flour 405（Like） | 5'AMCA（Like） | 5'C7-NH2 | 5'ET-TAMRA（Like） | 5'RHO 101（Like） |
| 5'Alexa Flour 488（Like） | 5'ATTO 425（Like） | 5'CHCH | 5'FAM | 5'ROX |
| 5'Alexa Flour 532（Like） | 5'ATTO 550（Like） | 5'CHO | 5'Ferrocene | 5'SF670（Like） |
| 5'Alexa Flour 546（Like） | 5'ATTO 565（Like） | 5'Cholesteryl（Like） | 5'FITC（Like） | 5'TAM |
| 5'Alexa Flour 555（Like） | 5'ATTO 594（Like） | 5'COOH | 5'HEX | 5'TET |
| 5'Alexa Flour 568（Like） | 5'ATTO 700（Like） | 5'CY3（Like） | 5'JOE | 5'THL C6 SH（Like） |
| 5'Alexa Flour 594（Like） | 5'ATTO Rho11（Like） | 5'CY5（Like） | 5'Maleimide | 5'THS C6 S-S（Like） |
| 5'Alexa Flour 647（Like） | 5'Azide(N3)（Like） | 5'CY5.5（Like） | 5'Methylene Blue（Like） | 5'triple Biotin（Like） |
| 5'Alexa Flour 680（Like） | 5'BHQ1（Like） | 5'CY5-M | 5'NED（Like） | 5'triple SH（Like） |
| 5'Alexa Fluor 610（Like） | 5'BHQ2（Like） | 5'CY7（Like） | 5'PET（Like） | 5'TXR（Like） |
| 5'Alexa Fluor 620（Like） | 5'BIO（Like） | 5'DAB | 5'PHO | 5'VIC（Like） |
| 5'Alexa Fluor 633（Like） | 5'BIO-TEG（Like） | 5'DBCO（Like） | 5'Quasar 570（Like） | 5'YakYel（Like） |
| Internal Modification | ||||
| (+A)(+C)(+G)(+T)（Like） | (dT-ATTO 550)（Like） | (dT-Quasar 570)（Like） | (dC-Alexa Flour 405)（Like） | (dC-BHQ1)（Like） |
| (5hmdC) | (dT-ATTO 565)（Like） | (dT-Quasar 670)（Like） | (dC-Alexa Flour 488)（Like） | (dC-BHQ2)（Like） |
| (C7-NH2) | (dT-ATTO 594)（Like） | (dT-Quasar 705)（Like） | (dC-Alexa Flour 532)（Like） | (dC-Biotin)（Like） |
| (-CT+Signal)（Like） | (dT-ATTO 655)（Like） | (dT-ROX) | (dC-Alexa Flour 546)（Like） | (dC-Chromeo 494)（Like） |
| (dI) | (dT-ATTO 700)（Like） | (dT-SF670)（Like） | (dC-Alexa Flour 555)（Like） | (dC-CY3)（Like） |
| (dSpacer) | (dT-ATTO Rho11)（Like） | (dT-TAM) | (dC-Alexa Flour 568)（Like） | (dC-CY5)（Like） |
| (dT-Alexa Flour 350)（Like） | (dT-Azide)（Like） | (dT-DNP)（Like） | (dC-Alexa Flour 594)（Like） | (dC-CY5-M) |
| (dT-Alexa Flour 405)（Like） | (dT-BHQ1)（Like） | (dU) | (dC-Alexa Flour 647)（Like） | (dC-Digoxin)（Like） |
| (dT-Alexa Flour 488)（Like） | (dT-BHQ2)（Like） | (m5dC) | (dC-Alexa Flour 680)（Like） | (dC-FAM) |
| (dT-Alexa Flour 532)（Like） | (dT-Biotin)（Like） | (PC Linker)（Like） | (dC-Alexa Fluor 610)（Like） | (dC-FITC)（Like） |
| (dT-Alexa Flour 546)（Like） | (dT-Chromeo 494)（Like） | (rA)(rC)(rG)(rU) | (dC-Alexa Fluor 620)（Like） | (dC-HEX) |
| (dT-Alexa Flour 555)（Like） | (dT-CY3)（Like） | (Spacer 18) | (dC-Alexa Fluor 633)（Like） | (dC-Maleimide) |
| (dT-Alexa Flour 568)（Like） | (dT-CY5)（Like） | (Spacer 9) | (dC-Alexa Fluor 700)（Like） | (dC-Methylene Blue)（Like） |
| (dT-Alexa Flour 594)（Like） | (dT-CY5-M) | (Spacer C12) | (dC-Alexa Fluor 750)（Like） | (dC-NH2) |
| (dT-Alexa Flour 647)（Like） | (dT-CY7)（Like） | (Spacer C3) | (dC-ATTO 425)（Like） | (dC-Quasar 570)（Like） |
| (dT-Alexa Flour 680)（Like） | (dT-Digoxin)（Like） | (Spacer C6) | (dC-ATTO 550)（Like） | (dC-Quasar 670)（Like） |
| (dT-Alexa Fluor 610)（Like） | (dT-FAM) | (SS) | (dC-ATTO 565)（Like） | (dC-Quasar 705)（Like） |
| (dT-Alexa Fluor 620)（Like） | (dT-FITC)（Like） | (TAO)（Like） | (dC-ATTO 594)（Like） | (dC-ROX) |
| (dT-Alexa Fluor 633)（Like） | (dT-HEX) | (XEN)（Like） | (dC-ATTO 655)（Like） | (dC-SF670)（Like） |
| (dT-Alexa Fluor 700)（Like） | (dT-Maleimide) | Phosphorothioate | (dC-ATTO 700)（Like） | (dC-TAM) |
| (dT-Alexa Fluor 750)（Like） | (dT-Methylene Blue)（Like） | ET-B/G/O/P/R/Y | (dC-ATTO Rho11)（Like） | |
| (dT-ATTO 425)（Like） | (dT-NH2) | (dC-Alexa Flour 350)（Like） | (dC-Azide)（Like） | |
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